Primer dimer artefaktları adətən böyük eşik dövr sayı (adətən > 35 dövr) ilə baş verir ki, bu da istənilən amplikon üçün eşik dövr sayından yüksəkdir. Heterolog genomik DNT əlavə edildikdə primer dimerləri nəzərəçarpacaq dərəcədə artır.
DNT gelində primer dimerləri harada görərdiniz?
Qeyri-kəmiyyətli son nöqtə PCR-də primer dimer agaroz geldə az və ya çox zəif ləkə kimi görünəcək, maraqlanan məhsul zolağının altında.
Əsas dimerlər necə əmələ gəlir?
Primer dimerləri iki primer bir-birinə bağlandıqda şablon DNT yerinə, primer tamamlayıcı bölgələrə görə əmələ gəlir.
Əsas dimerləri necə aşkar edirsiniz?
Primer-dimerləri yoxlamağın ən asan yolu mənfi nəzarətinizə (DNT və ya RNT əvəzinə su) reaksiyalarınızı müqayisə etməkdir. Primer dimerləri hələ də mənfi nəzarətdə formalaşacaq. Bəzi primer dəstləri digərlərinə nisbətən daha çox dimer əmələ gətirir.
Niyə primer dimerlər görünür?
Əsasən primer dimerləri PZR reaksiya qarışığında primerin yüksək konsentrasiyasına görə görülür. Və ya PCR gücləndirmə yoxdursa və agarose geldə primer dimerdə görə bilərsiniz. Əgər PCR məhsulunu görə bilirsinizsə, onda siz prime konsentrasiyasını azalda və digər şərtləri eyni saxlaya bilərsiniz.
