Molekulyar biologiyada STRING (Qarşılıqlı Təsirli Gen/Zülalların Axtarış Aləti) məlum və proqnozlaşdırılan zülal-zülal qarşılıqlı təsirlərinin bioloji verilənlər bazası və veb resursudur. … Ən son versiya 11b 5000-dən çox orqanizmə aid 24,5 milyon zülal haqqında məlumatı ehtiva edir.
STRING verilənlər bazasının məqsədi nədir?
STRING verilənlər bazası çoxlu sayda orqanizm üçün məlum və proqnozlaşdırılan protein – zülal assosiasiyası məlumatlarını birləşdirərək bu məlumatı toplamaq və inteqrasiya etməyi hədəfləyir.
STRING balı nədir?
STRING-də hər zülal-zülal qarşılıqlı əlaqəsi bir və ya daha çox "bal" ilə qeyd olunur. Əhəmiyyətli odur ki, bu ballar qarşılıqlı təsirin gücünü və ya spesifikliyini göstərmir. Əvəzində, onlar etibar göstəriciləridir, yəni, mövcud sübutlar nəzərə alınmaqla, STRING-in qarşılıqlı əlaqənin nə dərəcədə doğru olduğunu mühakimə edir.
Zülallar niyə qarşılıqlı təsir göstərir?
Zülal-zülal qarşılıqlı təsirləri (PPI) elektrostatik qüvvələr, hidrogen daxil olmaqla qarşılıqlı təsirlərlə idarə olunan biokimyəvi hadisələr nəticəsində iki və ya daha çox zülal molekulu arasında qurulmuş yüksək spesifikliyə malik fiziki təmaslardır birləşmə və hidrofobik təsir.
Funksional assosiasiya nədir?
tərif. Bioloji varlıqlar arasında ikili əlaqə onlardan biri digərinin funksiyası, ifadəsi, deqradasiyası və ya sabitliyi və əlaqə baxımından digərini modullaşdırdıqdatərəfdaşlar arasında birbaşa olaraq müəyyən edilə bilməz, buna görə də ara addımlar dolayısı ilə mövcuddur.